Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC19Q6DKK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC19Q6DKK2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC19Q6DKK2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC19Q6DKK2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC19Q6DKK2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms