Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPECC1LQ69YQ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPECC1LQ69YQ0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPECC1LQ69YQ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms