Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM1

AFMID, Kynurenine formamidase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMIDQ63HM1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AFMIDQ63HM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AFMIDQ63HM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms