Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SAMD13Q5VXD3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SAMD13Q5VXD3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms