Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRIP1Q5VSL9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRIP1Q5VSL9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms