Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM78Q5T7P6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM78Q5T7P6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms