Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4F4

ZFYVE27, Protrudin, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE27Q5T4F4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFYVE27Q5T4F4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFYVE27Q5T4F4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZFYVE27Q5T4F4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms