Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC39AQ5SRH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC39AQ5SRH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms