Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC38Q5R3I4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC38Q5R3I4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC38Q5R3I4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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