Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PAPPA-AS1Q5QFB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms