Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCNT1Q5JUK3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNT1Q5JUK3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNT1Q5JUK3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms