Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
WDR44Q5JSH3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
WDR44Q5JSH3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms