Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RTL5Q5HYW3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
RTL5Q5HYW3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RTL5Q5HYW3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms