Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
C4orf48Q5BLP8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C4orf48Q5BLP8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms