Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ALFQ53S48 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALFQ53S48 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms