Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZC2HC1CQ53FD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZC2HC1CQ53FD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZC2HC1CQ53FD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms