Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
DUSP28Q4G0W2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DUSP28Q4G0W2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DUSP28Q4G0W2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms