Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CFAP221Q4G0U5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CFAP221Q4G0U5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms