Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRT71Q3SY84 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT71Q3SY84 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms