Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIR4

TMEM30B, Cell cycle control protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30BQ3MIR4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM30BQ3MIR4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms