Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL38Q2WGJ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL38Q2WGJ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms