Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSNAXIP1Q2TAA8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNAXIP1Q2TAA8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms