Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TYSND1Q2T9J0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TYSND1Q2T9J0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms