Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SKIDA1Q1XH10 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SKIDA1Q1XH10 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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