Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KNOP1Q1ED39 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KNOP1Q1ED39 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNOP1Q1ED39 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms