Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTN1Q16799 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RTN1Q16799 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTN1Q16799 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
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