Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NDUFA9Q16795 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NDUFA9Q16795 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms