Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SGCBQ16585 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SGCBQ16585 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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