Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNAPC1Q16533 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNAPC1Q16533 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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