Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA6Q16445 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GABRA6Q16445 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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