Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMA4Q16363 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMA4Q16363 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
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