Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NTRK3Q16288 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK3Q16288 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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