Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP6AP1Q15904 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP6AP1Q15904 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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