Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
USF2Q15853 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
USF2Q15853 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
USF2Q15853 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
USF2Q15853 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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