Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC85BQ15834 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC85BQ15834 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC85BQ15834 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
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