Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIP4Q15650 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIP4Q15650 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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