Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIP13Q15645 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIP13Q15645 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms