Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CNN3Q15417 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNN3Q15417 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms