Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLR1Q15399 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TLR1Q15399 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TLR1Q15399 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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