Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PDCD1Q15116 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PDCD1Q15116 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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