Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NWD1Q149M9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NWD1Q149M9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NWD1Q149M9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms