Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CIRBPQ14011 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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