Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RASGRF1Q13972 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RASGRF1Q13972 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms