Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCINQ13939 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCINQ13939 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCINQ13939 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCINQ13939 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCINQ13939 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCINQ13939 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCINQ13939 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCINQ13939 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCINQ13939 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CCINQ13939 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCINQ13939 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCINQ13939 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCINQ13939 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCINQ13939 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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