Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CUL4BQ13620 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CUL4BQ13620 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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