Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB3Q13509 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TUBB3Q13509 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TUBB3Q13509 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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TUBB3Q13509 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB3Q13509 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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