Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXE3Q13461 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FOXE3Q13461 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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