Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SF3B2Q13435 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SF3B2Q13435 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
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