Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEMA3BQ13214 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEMA3BQ13214 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms