Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PSMD2Q13200 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PSMD2Q13200 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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